Le Conseil d'Administration est constitué de 24 membres dont 8 personnalités extérieures choisies en fonction de leurs compétences dans les domaines scientifique, économique, industriel ou administratif, 8 représentants des enseignants, des enseignants chercheurs et des chercheurs, 5 représentants des élèves ingénieurs, 2 représentants des personnels.
Le Directeur et l'Agent comptable assistent avec voix consultative aux séances.
Le Président de l'Université de Caen Basse Normandie est membre de droit.
Le Recteur de l'Académie représente le Ministre de l'Education Nationale auprès du Conseil d'Administration.
Le Conseil Scientifique est présidé par le Directeur Général de l'ENSICAEN, il est constitué de 24 membres dont 6 personnalités scientifiques, désignées par le Conseil d'Administration, le Président de l'Université de Caen Basse Normandie, 7 représentants des professeurs ou autres titulaires d'Habilitation à Diriger des Recherches, 4 représentants des autres personnels d'enseignement ou de recherche, 2 représentants des étudiants de 3ème cycle, 2 représentants des personnels de recherche, 1 représentant des personnels administratifs.
Le Conseil de Perfectionnement est présidé par le Directeur Général de l'ENSICAEN ou le Directeur des Etudes, il est constitué de 29 membres.
Le Bureau de Direction est composé du Directeur Général de l'Ecole, du Secrétaire Général, du Directeur des Etudes et Formations Internationales, du Directeur délégué à la recherche, du Directeur du Département des Relations Industrielles.