Les élèves ingénieurs de 3e année ont la possibilité de suivre un Master Recherche (MR). Tous les MR sont cohabilités par l'ENSICAEN et l'Université de Caen. Le MR de chimie organique est également cohabilité par l'Université et l'INSA de Rouen. La formation d'ingénieur est aménagée pour que suivre les 2 formations.